揭开你的细胞的全部故事
想知道你真正研究了你的单细胞样本吗?担心不再!SMART-SEQ单细胞套件的全长化学旨在捕获整个成绩单 - 为您提供识别罕见基因并检测SNP,融合和更多填充3'方法,如10X,可以错过的空白。
SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc)和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS)由强大的化学提供动力,为单细胞和细胞核应用提供无与伦比的灵敏度和重现性。这些试剂盒使用oligo(dT)引物直接从已知RNA含量低的单细胞(如PBMCs, t细胞,b细胞等)中生成高质量的全长cDNA。
SMART Seq单细胞试剂盒(SSsc)和SMART Seq单细胞PLUS试剂盒(SSsc PLUS)由强大的化学物质提供动力,为单细胞和细胞核应用提供无与伦比的灵敏度和再现性。这些试剂盒使用低聚物(dT)引发直接从已知RNA含量低的单个细胞(如PBMC、T细胞、B细胞等)生成高质量全长cDNA。除了cDNA合成试剂盒外,SSsc PLUS试剂盒还包括一个文库制备试剂盒和一个一次性使用的独特双索引(UDI)板,用于生成与Illumina兼容的测序文库,使其成为一个完整的端到端解决方案。
聪明的(s巫术M机制A.t 5'端RNATSMART-Seq Single Cell kit提供全长转录本信息,能够分析转录本异构体、基因融合、点突变等。该cDNA试剂盒提供了高重现性,甚至基因体覆盖,并准确表达了富含gc的转录本。我们进一步改进了这一强大的核心技术,以创建一种新的化学制剂,具有更高的灵敏度,专为单细胞应用。这些改进会产生更多有用的读取和更高的基因检测,从而更好地理解珍贵的样本。
SSsc PLUS试剂盒包括我们的专利文库制备试剂盒,该试剂盒结合了酶裂解和茎环适配器,以从核心试剂盒合成的cDNA构建高质量、与Illumina兼容的文库。此两步工作流程在单管中进行,可在大约两小时内完成,无需中间净化步骤,从而最大限度地减少样品混合、样品损失和交叉污染。该试剂盒产生的高文库产量提供了在高通量测序仪上测序的灵活性,同时提供了高再现性。
如果您对这些好处感兴趣,但正在与完整、高质量的细胞(< 1000)或超低总RNA输入工作,我们推荐我们的SMART Seq v4 PLUS套件.
如果您喜欢随机启动方法,该方法允许您处理降解样品,并包括库制备和索引试剂,我们建议智能Seq绞合套件.
图1。SMART-Seq单电池套件的性能优于SMART-seq2。用智能SEQ单细胞试剂盒(SSSC; 18个细胞)或使用19个循环的PCR处理来自智能SEQ单细胞试剂盒(SSSC; 18个细胞)或智能SEQ2方法(SMART-SEQ2; 20个细胞)的单细胞。生成RNA-SEQ文库库和分析序列(将所有样本标准化为175万次配对结束读数后)。A小组。两种化学试剂的读值分布不同,Smart-seq2化学试剂映射到线粒体基因组的读值数量大大增加(因此,用于基因鉴定的读值更少)。B小组。在SSsc处理的细胞中检测到更多的基因。有关再现性和灵敏度的其他数据,请查看我们的技术说明.
我们进一步改进了我们的核心技术,以创造一种专为单细胞应用而设计的具有更高灵敏度的新化学。我们证明,新的SSsc试剂盒生成的数据比SMART Seq v4试剂盒(SSv4)具有更好的灵敏度和再现性。
图2. SMART-SEQ单细胞套件的改进化学高度适用于单细胞应用。A小组。12使用来自PCR的19个循环的SSV4或SSSC处理来自淋巴细胞胆管线GM22601的单细胞。所有样品均向12.25亿配对读数标准化。用SSSC产生的cDNA产量大大高于SSV4产生的产量。B小组。用SSv4或SSsc处理来自一个供体的约50个单个PBMC。不管用于分析的读取次数如何,在使用SSsc处理的细胞中检测到的基因大约多出60%。
SMART Seq Single Cell PLUS试剂盒旨在直接从单细胞合成高质量的全长cDNA,然后生成Illumina ready测序文库。
图3. SSSC Plus生成更多库并识别比Nextera®XT更多的基因。A小组。SMART-Seq单细胞试剂盒用于从10 pg小鼠脑总RNA中产生一式三份的cDNA。然后使用SSsc PLUS工具包或Nextera XT的SMART Seq Library Prep Kit部分生成与Illumina兼容的库。在NextSeq®500上对库进行测序。读取被标准化为4M成对末端读取,并按照中所述进行分析技术说明.B小组。使用SSSC Plus试剂盒获得的图书馆产量高于Nextera XT产生的产率。面板C.与Nextera XT相比,SSsc PLUS试剂盒还识别了更多的基因。
有关存储条件、产品部件、技术规格等信息,请参见产品分析证书。请参阅产品部件清单确定套件部件。“分析证书和产品组件清单”位于“文档”页签下。
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