智能鼠标TCR a/b分析工具包获得TCRα和TCRβV(D)J可变区的全长序列
SMARTer Mouse TCR a/b分析工具包为那些试图使用NGS进行T细胞受体(TCR)分析的人提供了一个强大的新解决方案。该试剂盒采用基于5’-RACE的方法捕获TCR转录本的完整V(D)J可变区,从小鼠脾脏、胸腺或PBMC或1000至10000个纯化T细胞获得的总RNA量从10 ng到500 ng不等。顾名思义,该试剂盒可用于生成TCRα链和TCRβ链多样性的数据,无论是在同一个实验中还是单独进行。
SMARTer Mouse TCR a/b分析工具包为那些试图使用NGS进行T细胞受体(TCR)分析的人提供了一个强大的新解决方案。该试剂盒采用基于5’-RACE的方法捕获TCR转录本的完整V(D)J可变区,从小鼠脾脏、胸腺或PBMC或1000至10000个纯化T细胞获得的总RNA量从10 ng到500 ng不等。顾名思义,该试剂盒可用于生成TCRα链和TCRβ链多样性的数据,无论是在同一个实验中还是单独进行。
与涉及PCR复用的TCR分析方法相比,每一轮文库扩增利用单个引物对每个TCR亚单位,从而提高效率并降低引物二聚体形成的可能性。已知基于多重PCR的方法可促进引物相关的序列特异性偏倚;我们基于种族的方法不存在这种偏差,因为所有可变区域都是从相同的恒定区域序列中启动的。使用我们的~4-hr协议,使用该试剂盒生成的库被编入索引,并准备在Illumina平台上进行测序。
这套工具包充分利用了我们经过验证的SMART (s巫术M机制A.t 5'端RNAT(emplate)技术和LNA技术以无偏的方式扩增TCR mRNA序列,具有显著的灵敏度。
概述
- 完整的V(D)J序列信息-获得TCR mRNA转录本可变区域的全长序列。
- TCRα和TCRβTCR亚基的-profile多样性,无论是在同一实验中还是单独实验中。
- 不需要多重PCR每个反应用单个引物对扩增每个TCR亚基的序列。
- Illumina ready测序库-以独立连接的方式合并Illumina适配器和索引序列,并在单个流细胞通道中复用多达96个库。
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应用
小鼠TCR库分析(TCR- α和TCR- β亚单位)
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