用于COVID-19研究的实时定量pcr
突出显示的出版物:快速,经济高效地检测SARS-COV-2具有Primescript III一步RT-QPCR的变体
在一个2021年1月bioRxiv论文Korukluoglu和来自土耳其世卫组织流感中心和Bioeksen研发技术的其他作者报告了该报告SARS-CoV-2突变的快速RT-qPCR检测方法的建立该检测采用Bioeksen公司的Bio-Speedy SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒一个步骤primescript III RT-QPCR混合与多种水解探针和引物配对。
他们的分析重点是最近出现的Spike N501Y和HV69-70del突变,这与更高的传播率和从中和抗体逃逸的可能性有关。目前检测SARS-CoV-2变异的方法依赖于基于测序的技术,这是昂贵和耗时的。快速和准确的变异流行率估计对流行病学至关重要,因为需要迅速实施具体措施,以防止SARS-CoV-2病例激增。
该分析的循环条件是基于较早发表的参赛等。该报告使用One Step PrimeScript III RT-qPCR Mix对SARS-CoV-2进行了<20 min的检测。使用Takara Bio Mix的快速协议适用于由于单管反应格式,预混合试剂和处理1-秒的变性和1-SEC退火/延伸步骤的多管反应格式,预混试剂和能力的多种设备.
批判性地,在超过1000个临床样本中评估了新的变异检测方法,结果与下一代测序和Sanger测序技术100%一致,表明了特异性和准确性。现在,可以对更多的SARS-CoV-2阳性样本进行已知突变的筛查,随着病毒继续进化,可以将潜在的未来变异添加到这种方法中。
阅读EUAs、出版物和与已建立的引物/探针集的兼容性研究中关于该产品的更多信息。
最近出现的冠状病毒SARS-CoV-2(导致COVID-19的病毒)导致需要进行快速和可靠的检测。Takara Bio为研究这种新型冠状病毒的研究人员和临床医生提供解决方案,例如病毒RNA纯化试剂盒,总会在包,以及RT-qPCR试剂盒,可与已建立的引物一起用于灵敏检测SARS-CoV-2至5个拷贝(图1)。
Takara生物试剂在FDA紧急使用授权
我们在ISO 13485:2016条件下生产的高质量试剂已被用于联邦药品管理局(FDA)颁发的多项COVID-19检测紧急使用授权:
图1所示。用我们的一步RT-qPCR试剂盒可靠检测SARS-CoV-2的5,50,500,5,000和50,000拷贝。这些数据是由Takara Bio利用CDC的公开协议生成的。这些数据还没有得到CDC的验证。
出版物
使用PrimeScript III一步RT-qPCR快速、经济地检测SARS-CoV-2变异
在一个2021年1月bioRxiv论文Korukluoglu和来自土耳其世卫组织流感中心和Bioeksen研发技术的其他作者报告了该报告SARS-CoV-2突变的快速RT-qPCR检测方法的建立该检测采用Bioeksen公司的Bio-Speedy SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒一个步骤primescript III RT-QPCR混合与多种水解探针和引物配对。
他们的分析重点是最近出现的Spike N501Y和HV69-70del突变,这与更高的传播率和从中和抗体逃逸的可能性有关。目前检测SARS-CoV-2变异的方法依赖于基于测序的技术,这是昂贵和耗时的。快速和准确的变异流行率估计对流行病学至关重要,因为需要迅速实施具体措施,以防止SARS-CoV-2病例激增。
该分析的循环条件是基于较早发表的参赛等。该报告使用One Step PrimeScript III RT-qPCR Mix对SARS-CoV-2进行了<20 min的检测。使用Takara Bio Mix的快速协议适用于由于单管反应格式,预混合试剂和处理1-秒的变性和1-SEC退火/延伸步骤的多管反应格式,预混试剂和能力的多种设备.
批判性地,在超过1000个临床样本中评估了新的变异检测方法,结果与下一代测序和Sanger测序技术100%一致,表明了特异性和准确性。现在,可以对更多的SARS-CoV-2阳性样本进行已知突变的筛查,随着病毒继续进化,可以将潜在的未来变异添加到这种方法中。
采用PrimeScript III一步RT-qPCR,高灵敏度、快速检测SARS-CoV-2
2020年4月Biorxiv论文,棕色(的)et al。来自大奥蒙德街医院(NHS,伦敦,英国)的研究人员进行了比较一个步骤primescript III RT-QPCR混合对于Quantifast Multiplex PCR + R主混音(QIAGEN),Taqman快速病毒1-Step主混音(Thermo),以及TaqPath一步RT-QPCR主混合物(Thermo),以测试SARS-COV-2检测的兼容性和灵敏度.
在最初的检测限实验中,One Step PrimeScript III RT-qPCR Mix用所有三种引物/探针方法一致地检测到1个病毒拷贝/µl,显示出较高的灵敏度。作者表明该试剂盒的检测下限是竞争产品的10 ~ 100倍.
接下来,作者测试了来自疑似SARS-CoV-2感染病例患者的鼻子和/或喉咙拭子的74个真实样本。他们比较了PrimeScript III混合试剂盒和Quantifast multiplex试剂盒(Qiagen)。74个棉签样本中,67/74显示两种主混合的结果一致。然而,在不一致的结果中,PrimeScript III mix可以检测到7个低RNA样本输入的患者样本(中位数Ct = 40.9[范围38.5-41.9]),而这些样本被Quantifast检测不到,说明PrimeScript III一步RT-qPCR灵敏度的提高减少了假阴性的数量.
此外,作者比较了所有混合物的整体反应速度。的PrimeScript III一步RT-qPCR实验可以在不到1小时内完成(比Quantifast Multiplex PCR +R master mix快33%),这意味着更快地检测出SARS-CoV-2感染。更快的反应速度将有助于提高COVID-19诊断实验室的吞吐量。
棕色(的)et al。结论:One Step PrimeScript III RT-qPCR Mix在灵敏度和速度上均优于其他一步式RT-qPCR溶液.在当前对SARS-CoV-2感染筛查至关重要的时代,One Step PrimeScript III RT-qPCR Mix的效率和速度在本次大流行的最佳管理和控制中发挥着至关重要的作用。
2020年7月medRxiv纸, Reijnset al。来自爱丁堡大学的研究人员还发现,在对患者样本进行多重反应时,One-Step PrimeScript III RT-qPCR Mix表现出了更高的敏感性。关键的是,他们报告称,这种混合物能够检测出之前使用TaqPath COVID-19组合试剂盒发现为阴性的阳性样本。此外,他们还报告说,使用Takara Bio mix开发的试剂盒的价格是其他试剂盒的十分之一。这些数据加强了我们在检测SARS-CoV-2方面的出色表现和价值。
与已发布的SARS-CoV-2检测协议的引物/探针套件的兼容性
采用qPCR方法检测SARS-CoV-2一个步骤primescript III RT-QPCR混合和PrimeDirect Probe RT-qPCR Mix的公开协议,引物集来自美国和中国疾控中心、世界卫生组织和日本NIID。该分析的灵敏度取决于模板的性质。日本NIID协议中使用的模板由NIID提供,其他协议中使用的模板由Takara Bio制备的RNA合成。你可以通过点击下面的PDF缩略图下载我们的结果。
中国疾控中心还发表了一篇论文,使用我们的试剂盒检测SARS-CoV-2 (Zhu et al. 2019).
该结果是由Takara Bio按照公开的协议生成的。在这些协议中使用我们的产品没有经过外部机构的验证,也没有经过我们的研发团队的优化。这些数据仅供说明之用。有关这些协议的更多信息,请参阅已发表的文献。
我们有批量的一步RT-qPCR试剂盒。如果您感兴趣,请通过您的询问联系我们.
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更多的信息
Takara Bio RT-PCR试剂盒检测SARS-CoV-2的引文
- 哈肯萨克大学医学中心(HUMC)分子病理学实验室CDI增强COVID-19检测EUA摘要(2020年4月15日)。可从https://www.fda.gov/media/137036/download上读取。
- COV-19 IDx检测EUA摘要,Ipsum Diagnostics, LLC(2020年4月1日)。可从https://www.fda.gov/media/136621/download上读取。
- 布朗,j . R。et al。SARS-CoV2 N基因实时RT-PCR靶点与市售母混物的比较bioRxiv2020.04.17.047118;doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.17.047118
- Reijns, m。et al。一种灵敏、经济的多重RT-qPCR检测SARS-CoV-2的方法。medRxiv2020.07.14.20154005;doi: https://doi.org/10.1101/2020.07.14.20154005
- 朱,N。et al。一种新型冠状病毒来自2019年中国肺炎患者。心血管病。j .地中海。NEJMoa2001017(2020)。
有关产品信息和可用尺寸的完整清单,请访问:
- One Step PrimeScript III RT-qPCR Mix产品页面
- 一步Primescript RT-PCR套件(完美实时)产品页面
- PrimeDirect Probe RT-qPCR Mix产品页面
更多的产品信息
有关存储条件、产品部件、技术规格等信息,请参见产品分析证书。请参阅套件组件清单确定套件组件。分析证书和套件组件清单位于“文档”页签下。
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了解你的敌人:在不确定的时期找到确定性
本博客重点介绍了识别和描述新型冠状病毒的首批研究之一,最终促成了病毒基因组序列在全球范围内共享。
新型冠状病毒的一步RT-qPCR筛选
了解研究人员如何识别一种新型的高传染性冠状病毒,并开发一步RT-qPCR筛查方案。
Takara Bio在抗击新型冠状病毒方面发挥着关键作用
了解Takara在中国大连的员工如何不知疲倦地工作,以跟上对一步PrimeScript RT-PCR试剂盒的需求,这是检测新冠病毒的关键组件。
在原地不动的情况下进入新世界
听听欧洲一位产品经理是如何适应新冠肺炎疫情带来的研究市场变化的。
努力满足新冠病毒检测生产需求
听听Takara Bio一名27年的员工是如何为抗击COVID-19做出贡献的。
用新型疫苗取代冠状病毒国王
请了解目前有哪些类型的SARS-CoV-2疫苗,以及Takara Bio是如何加入这场战斗的。
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通过高通量qPCR实现病毒自动检测
了解可用于研究和检测包括SARS-CoV-2在内的病毒的高通量qPCR系统。
Takara Bio产品出现在COVID-19出版物中
不断增加使用Takara生物产品和技术的新冠病毒出版物的汇编。
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