有说服力的NGS分析管道
版本1.0
概述
Cogent™NGS分析管道(也称为CogentAP)从测序和CellSelect软件生成的井表文件(或用户生成的井表文件)中获取输入数据,并输出HTML报告和其他文件,如基因矩阵,以继续进行进一步分析。R数据对象也是输出,可以作为输入Cogent NGS发现软件.
CogentAP HTML报告中提供的示例输出。
安装完成后,软件由以下特性组成:
- CogentAP GUI发射器
- 命令行界面程序
- 迷你数据集文件(WellList.txt和FASTQ文件)-可以用来测试CogentAP功能
- 示例输出报告和统计数据—与迷你数据集测试的分析结果进行比较
支持操作系统
CogentAP可以安装在以下版本的Linux上:
- CentOS
- Ubuntu
- RedHat
硬件需求
Illumina NextSeq®高输出数据分析:
- 24核CPU
- 64 GB + RAM
- 500gb +可用硬盘空间
在计算能力低于上述规格的服务器上,也可以分析MiniSeq™或MiSeq®数据。HiSeq®或NovaSeq™数据的分析需要比列出的更好的硬件。
额外的第三方软件依赖
- Conda(或Miniconda3)
- bcl2fastq转换软件
*不包括在软件内;必须单独下载和安装。
更多的产品信息
与ICELL8 cx单细胞系统、ICELL8单细胞系统的工作流程结合使用,或选择Takara Bio UMI试剂盒。更多信息可以在Cogent NGS分析管道v1.0中找到用户手册和快速入门指南.
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