甲基化对限制酶活性的影响
许多DNA分子含有甲基化的碱基。当限制性内切酶识别位点被甲基化时,DNA切割可能会被阻断,这取决于限制性内切酶和甲基化的类型。最紧张的大肠杆菌有两个位点特异性DNA甲基化酶(甲基转移酶)、Dam甲基化酶(G6mATC)和Dcm甲基化酶(C5mCA/TGG)。因此,DNA分子从大坝+扩张型心肌病+大肠杆菌菌株在GATC和CCAGG/CCTGG序列上被甲基化。此外,一些哺乳动物DNA分子被CG甲基化酶(5mCG)甲基化。
下表列出了受Dam甲基化酶、Dcm甲基化酶或CG甲基化酶介导的甲基化影响的酶切酶活性。还提供了每个甲基化酶识别的序列。请参阅下面脚注表格额外的细节。
得了,D–K,M-Z
得了,D–K,M-Z
限制酶 | 认出 序列1. |
甲基化酶影响限制性内切效率及其识别序列 | 卵裂位点被甲基化阻断2. | 序列不受影响 甲基化 (引用文献等) |
受影响的序列 甲基化 (引用文献等) |
Aat二, | GACGTC | CG甲基化酶(5米CG) | GA5米CGTC | GA5米CGTC GACGT5米C |
|
行政协调会我 | GTMKAC | CG甲基化酶(5米CG) | GTMKA5米CG 燃气轮机5米CGAC |
GTMK6米自动控制 GTMKA5米C3. 燃气轮机5米CGAC4. |
|
行政协调会二, | CGCG | CG甲基化酶(5米CG) | 5米CG5米CG | 5米CGCG | |
行政协调会3 | TCCGGA | dam甲基化酶(G6米ATC) | TCCGG6米空中交通管制 | T5米CCGGA 总费用5米CGGA3. |
TCCGG6米A. |
Afa我 | GTAC | CG甲基化酶(5米CG) | 侠盗猎车手5米CG | 侠盗猎车手5米C3,4 | |
Afl二, | CTTAAG | 5米CTTAAG CTTA6米银 |
|||
阿卢我 | AGCT | 6米AGCT 银4米计算机断层扫描 银5米计算机断层扫描 银5嗯计算机断层扫描 |
|||
Aor13个嗨 | TCCGGA | CG甲基化酶(5米CG) | 总费用5米CGGA | 总费用5米CGGA | |
Aor51嗨 | AGCGCT | CG甲基化酶(5米CG) | 银5米CGCT | 银5米CGCT4. | |
Apa我 | GGGCCC | dcm甲基化酶(C5米CWGG) CG甲基化酶(5米CG) |
GGGCC5米CWGG GGGCC5米CG |
GGG5米CCC GGGCC5米C |
|
ApaLI | GTGCAC | CG甲基化酶(5米CG) | GTGCA5米CG | GTG5米CAC GTGC6米自动控制 |
GTGCA5米C |
AvaI | CYCGRG | CG甲基化酶(5米CG) | 赛义德5米CGRG | C5米CCGGG | 5米CYCGRG 赛义德5米CGRG CTCG6米银3. |
AvaII | GGWCC | dcm甲基化酶(C5米CWGG) CG甲基化酶(5米CG) |
GGWC5米CWGG GGWC5米CG |
GGWC4米C*3 | GGW5米科科斯群岛 GGWC5米C GGW5嗯碳五hmC |
落下帷幕我 | TGGCCA | dcm甲基化酶(C5米CWGG) | TGGC5米CAGG | TGG5米CCA TGGC5米加利福尼亚州 |
|
BamHI | GGATCC | GGATC4米C GGATC5米C 游戏打得好6米写明ATCC GG66米空中交通管制5米C |
格特4米科科斯群岛 格特5米科科斯群岛 格特5嗯C5嗯C |
||
BanII | GRGCYC | GRGCY5米C | GRG5米赛克 | ||
Bcn我 | CCSGG | 5米CCSGG C5米CSGG |
C4米CSGG | ||
Bgl我 | GCCN5GGC | CG甲基化酶(5米CG) | GCCN5GG5米CG | GC5米CN5GGC | G5米CCN5GGC GCCN5GG5米C GC4米CN5GGC |
Bgl二, | AGATCT | 银6米正规 | 阿加特设计局5米计算机断层扫描 阿加特设计局5嗯计算机断层扫描 |
||
左右我 | CCTAGG | ||||
BmeT110I | CYCGRG | 科科斯群岛5米CGRG CTCG6米银 银5米CTCGGG 5米CCCGGG |
|||
BmgT120I | GGNCC | dcm甲基化酶 (C5米CWGG) CG甲基化酶(5米CG) |
GGNC5米CWGG GGNC5米CG |
游戏打得好5米CCC GGK5米科科斯群岛 |
|
Bpu1102I | GCTNAGC | ||||
BspT104I | TTCGAA | CG甲基化酶(5米CG) | TT5米CGAA | TT5米CGAA | |
BspT107I | GGYRCC | ||||
Bsp1286I | GDGCHC | GDGCH5米C | GDG5米CHC | ||
Bsp1407I | TGTACA | ||||
BssHII | GCGC | CG甲基化酶(5米CG) | G5米CG5米公司治理文化 | G5米CGCGC | |
BstPI | GGTNACC | GGTNAC5米C4. | |||
BstXI | CCAN6TGG | CCAN4.C5米CTGG4. | 5米CCAN6.TGG | ||
Bst1107I | GTATAC | CG甲基化酶(5米CG) | GTATA5米CG | GTATA5米C | |
Cfr10I | RCCGGY | CG甲基化酶(5米CG) | 钢筋混凝土5米CGGY | R5米CCGGY 钢筋混凝土5米CGGY4. |
|
Cfr13I | GGNCC | dcm甲基化酶 (C5米CWGG) CG甲基化酶(5米CG) |
GGNC5米CWGG GGNC5米CG |
GGN5米科科斯群岛 GGNC5米C3, 4 |
|
Cla我 | ATCGAT | dam甲基化酶(G6米ATC) CG甲基化酶(5米CG) |
G6米ATCGAT ATCG6米空中交通管制 在5米CGAT |
6米ATCGAT ATCG6米在 在5米CGAT |
|
Cpo我 | CGGWCCG | CG甲基化酶(5米CG) | 5米CGGWC5米CG | CGGW5米在204. CGGWC5米CG4. |
|
得了,D–K,M-Z |
|||||
限制酶 | 认出 序列1. |
甲基化酶影响限制性内切效率及其识别序列 | 卵裂位点被甲基化阻断2. | 序列不受影响 |
受影响的序列 |
德赖 | TTTAAA | TTTA6米AA | |||
运算单元我 | YGGCCR | dcm甲基化酶 (C5米CWGG) CG甲基化酶(5米CG) |
YGGC5米CAGG YGGC5米CG |
YGG5米CCR YGGC5米铬 |
|
Eco65i | GGTNACC | GGTNAC5米可以4. | |||
EcoO109I | RGGNCCY | dcm甲基化酶 (C5米CWGG) |
RGGNC5米CTGG | RGGNC5米赛义德 | |
EcoRI | 砷化镓 | CG甲基化酶(5米CG) | GAATT5米CG | GAATT5嗯C 棉酚5嗯U5嗯加州大学 |
G6米AATTC GA6米ATTC GAATT5米C3. |
多克隆位点 | GATATC | 加塔特5米CGATAT5嗯C | G6米ATATC 手枪6米空中交通管制 |
||
EcoT14I | CCWWGG | ||||
EcoT22I | ATGCAT | ATG5米猫 ATGC6mAT |
|||
Eco52I | CGGCCG | CG甲基化酶(5米CG) | 5米CGGC5米CG | 5米CGGCCG * 4 CGGC5米CG * 4 CGG5米CCG*4 |
|
Eco81I | CCTNAGG | ||||
Fba我 | TGATCA | dam甲基化酶(G6米ATC) | 甘油三酯6米《外国人侵权索赔法案》 | 甘油三酯6米《外国人侵权索赔法案》 | |
霍英东我 | GGATG (CATCC) | 猫5米科科斯群岛 CATC4米C CATC5米C*3 |
C6米写明ATCC 游戏打得好6米ATG |
||
工程师协会我 | GGCCGGCC | CG甲基化酶(5米CG) | GGC5米CGGCC | 游戏打得好5米CCGGCC 游戏打得好5米CCGG5米科科斯群岛 GGC5米CGGCC |
|
拥有二, | RGCGCY | CG甲基化酶(5米CG) | RG5米CGCY | RG5米CGCY RGCG5米赛义德3. RG5嗯CG5嗯赛义德 |
|
拥有3 | GGCC | GGC5米C | 游戏打得好5米科科斯群岛3. 游戏打得好5嗯C5嗯C |
||
HapII | CCGG | CG甲基化酶(5米CG) | C5米CGG | C5米CGG | |
铁道我 | GCGC | CG甲基化酶(5米CG) | G5米公司治理文化 | G5米公司治理文化 GCG5米C G5嗯CG5嗯C |
|
Hinc二, | GTYRAC | 格提拉5米C 燃气轮机5米CGAC4. |
GTYR6米自动控制 格提拉5嗯C |
||
HindIII | AAGCTT | A.6米AGCTT AAGC5嗯U5嗯U |
6米AAGCTT AAG5米结论 亚美大陆煤层气有限公司5嗯结论 |
||
Hinf我 | GANTC | 甘特图5米C3. | G6米ANTC 甘特图5嗯C |
||
Hin1I | GRCGYC | CG甲基化酶(5米CG) | GR5米CGYC | GRCGY5米C3,4 | GR5米CGYC |
下丘脑-垂体-肾上腺轴的我 | GTTAAC | GTTAA5米C | GTTA6米自动控制 GTTAA5嗯C G5嗯U5嗯UAAC |
||
KpnI | GGTACC | GGTA5米科科斯群岛 GGTA5米C5米C GGTAC5米C |
GGT6米ACC GGTAC4米C |
||
得了,D–K,M-Z |
|||||
限制酶 | 认出 序列1. |
甲基化酶影响限制性内切效率及其识别序列 | 卵裂位点被甲基化阻断2. | 序列不受影响 甲基化 (引用文献等) |
受影响的序列 甲基化 (引用文献等) |
Mbo我 | GATC | dam甲基化酶(G6米ATC) | G6米空中交通管制 | 手枪4米C 手枪5米C GA5嗯加州大学 |
G6米空中交通管制 手枪5嗯C |
Mbo二, | 砷化镓 (TCTTC) |
dam甲基化酶(G6米ATC) | GAAG6米空中交通管制 | T5米结论5米C3. G6米阿加 |
GA6米AGA GAAG6米A. |
漏磁场我 | RGATCY | dam甲基化酶(G6米ATC) | RG6米ATCY | 6米AGATCY3. | RG6米ATCY RGAT4米赛义德 RGAT5米赛义德 |
反光镜锁定我 | ACGCGT | CG甲基化酶(5米CG) | A.5米CG5米资本利得税 | 6米ACGCGT | A.5米CGT |
Msp我 | CCGG | 4米CCGG C4米CGGC 5米CGG3. |
5米CCGG 5嗯C5嗯CGG |
||
市政 | CAATTG | 加利福尼亚州6米ATTG | |||
Mva我 | CCWGG | 5米CCWGGC5米CWGG | 4米CCWGG 5米C5米CWGG C4米CWGG 科科斯群岛6米gg |
||
NaeI | GCCGGC | CG甲基化酶(5米CG) | GC5米CGGC GCCGG5米CG |
G5米CCGGC GC5米CGGC GCCGG5米C |
|
士官我 | CCATGG | 科科斯群岛6米ATGG | 4米CCATGG 5米CCATGG |
||
无损检测我 | 卡塔格 | 5米卡塔格 | |||
Nhe我 | GCTAGC | CG甲基化酶(5米CG) | GCTAG5米CG | GCTAG5米C | |
NotI | GCGGCCGC | CG甲基化酶(5米CG) | G5米CGGC5米公司治理文化 | GCGGCCG5米C | GCGG5米CCGC GCGGC5米公司治理文化 |
Nru我 | TCGCGA | dam甲基化酶(G6米ATC) CG甲基化酶(5米CG) |
TCGCG6米空中交通管制 T5米CG5米注册会计师 |
TCG5米注册会计师 | GCGG5米CCGC GCGGC5米公司治理文化 |
讲我 | TGCGCA | CG甲基化酶(5米CG) | 甘油三酯5米CGCA | TGCGC6米A. | 甘油三酯5米CGCA |
PmaCI | CACGTG | CG甲基化酶(5米CG) | 加利福尼亚州5米CGTG | 加利福尼亚州5米CGTG4. | |
PshAI | GACN4.吸收 | CG甲基化酶(5米CG) | GA5米CGN3.吸收 | GACN4.燃气轮机5米C4. | GA5米CN4.吸收4. |
PshBI | 阿塔特 | ||||
Psp1406I | AACGTT | CG甲基化酶(5米CG) | AA5米CGTT | AA5米CGTT | |
太平洋标准时间我 | CTGCAG | 5米CTGCAG CTGC6米银 C5嗯UGCAG |
|||
Pvu我 | CGATCG | CG甲基化酶(5米CG) | 5米CGAT5米CG | CG6米ATCG | CGAT4米CG CGAT5米CG |
Pvu二, | CAGCTG | CAG4米CTG CAG5米CTG |
|||
尚驰 | GAGCTC | G6米AGCTC GAGCT5米C |
呕吐5米CTC | ||
SacII | CCGCGG | CG甲基化酶(5米CG) | C5米CG5米CGG | 5米CCGCGG C5米CGCGG |
|
萨利· | GTCGAC | CG甲基化酶(5米CG) | 燃气轮机5米CGAC | GTCGA5米C | 燃气轮机5米CGAC GTCG6米自动控制 |
索伊 | GATC | CG甲基化酶(5米CG) | 手枪5米CG | G6米空中交通管制 GA5嗯加州大学 |
手枪4米C 手枪5米C3. 手枪5嗯C |
Sca我 | 阿格塔特 | 阿格塔5米计算机断层扫描 | |||
你以后我 | GGCCN5.GGCC | dcm甲基化酶 (C5米CWGG) CG甲基化酶(5米CG) |
GGC5米CWGGN2.GGCC GGCCN5.GGC5米CWGG GGCCN5.GGC5米CG |
游戏打得好5米CCN5.游戏打得好5米科科斯群岛 | 游戏打得好4米CCN5.GGCC GGC5米CN5.GGCC GGCCN5.GGC5米C |
Sma我 | CCCGGG | CG甲基化酶(5米CG) | 科科斯群岛5米CGGG | C5米CCGGG | 4米CCCGGG 5米CCCGGG C4米CCGGG 科科斯群岛4米CGGG 科科斯群岛5米CGGG3. |
重度我 | ATTTAAAT | ||||
斯纳比 | TACGTA | CG甲基化酶(5米CG) | 助教5米CGTA | T6米ACGT6米A. 助教5米CGTA |
|
Spe我 | ACTAGT | 6米ACTAGT A.5米CTAGT |
|||
Sph我 | GCATGC | GCATG5米C G5嗯CATG5嗯C |
GC6米ATGC | ||
Sse8387I | CCTGCAGG | 5米CGCCTGCAGG5米CG4. | 5米CCTGCAGG4. C5米CTGCAGG4. CCTG5米CAGG4. CCTGC6米gg4. |
||
Ssp我 | AATATT | 6米AATATT | |||
StuI | AGGCCT | dcm甲基化酶 (C5米CWGG) |
AGGC5米CTGG | gg5米有条件现金转移支付 AGGC4米计算机断层扫描 AGGC5米计算机断层扫描 |
|
Taq我 | , TCGA | dam甲基化酶(G6米ATC) | TCG6米空中交通管制 | T5米注册会计师 | TCG6米A. T5嗯注册会计师 |
Tth111I | GACN3.吸收 | GA5米CN3.燃气轮机5米C GACN3.燃气轮机5米C4. |
|||
凡尼 | CCAN5.TGG | dcm甲基化酶 (C5米CWGG) |
C5米CAGGN3.TGG | C5米可以5.TGG | |
VpaK11BI | GGWCC | dcm甲基化酶 (C5米CWGG) CG甲基化酶(5米CG) |
GGWC5米CWGG GGWC5米CG |
GGWC5米C | |
Xba我 | TCTAGA | dam甲基化酶(G6米ATC) | TCTAG6米空中交通管制 | T5米CTAGA3. TCTAG6米A. T5嗯CTAGA |
|
Xho我 | CTCGAG | 计算机断层扫描5米CGAG3, 4 | 5米CTCGAG CTCG6米银 |
||
Xsp我 | CTAG | 5米CTAG |
1. | 男:A或C | ||
K:G还是T | |||
N: A或C或G或T | |||
R:A还是G | |||
Y: C或T | |||
W:A还是T | |||
S:C或G:H:A或C或T | |||
H: A或C或T | |||
D:A或G或T | |||
4米C:N4甲基胞嘧啶 | |||
5米C:C5甲基胞嘧啶 | |||
5嗯C:碳五-羟甲基胞嘧啶 | |||
6米答:N6-methyl腺嘌呤 |
2. | CG情况下methyalse可部分消化奥贝德. |
3. | 行政协调会我:裂纹慢慢地unmethylated一串半甲基化GTMKA5米C | ||
行政协调会3:劈开TC5米CGGA缓慢(1/75)。 | |||
Afa我:劈开半甲基化侠盗猎车手5米C,但不能切割双甲基化的GTA5米C | |||
艾娃:我缺口的unmethylated一串半甲基化CTCG5米AG)缓慢。 | |||
Ava II:解理GGWC4米C缓慢。 | |||
落下帷幕我:如果与dcm站点(TGGC)重叠5米CAGG),消化速度变得非常慢(小于1/50)。 | |||
Bgl我:虽然劈开半甲基化GC5米CN5GGC, GC4米CN5GGC和GCCN5GG5米C缓慢,几乎不能裂解双甲基化的M。拥有三,-Bgl我喜欢这个网站。 | |||
Cfr13我:劈不开半甲基化GGNC5米C | |||
Cla我:劈开半-甲基化5米慢慢地。 | |||
EcoR我:虽然劈开半甲基化GAATT5米C,不能裂解双甲基化的GAATT5米C | |||
霍英东我:劈开CATC5米C慢慢地(1/2到1/4)。 | |||
拥有二,:切割RGCG5米很慢。 | |||
拥有3:缺口的unmethylated一串半甲基化GG5米CC。 | |||
Hin1我:劈开GRCGY5米C非常缓慢。 | |||
后第三:劈开半甲基化亚美大陆煤层气有限公司5米慢点。 | |||
Hinf我:劈开甘特图5米C缓慢(1/10)。 | |||
Kpn我:受半甲基化GGTA5米CC和GGTAC5米C,消化半甲基化GGTA5米C5米C缓慢。 | |||
Mbo二,:据报道,这是无法消化的半甲基化T5米结论5米C | |||
漏磁场我:劈开6米阿加奇慢慢地。 | |||
Msp我:劈开GGC5米CGG非常慢。 | |||
Mva我:刻痕半甲基化CC6米gg和unmethylated一串半甲基化4米CCWGG。 | |||
太平洋标准时间我:劈开半甲基化5米CTG5米CAG缓慢。 | |||
Pvu二,:劈开半甲基化5米CAG5米CTG缓慢。 | |||
萨尔:我劈开半甲基化GT5米CGAC缓慢。 | |||
Sau3A我:缺口的unmethylated一串半-甲基化GAT5米C.据报道,消化速度5米AGATC变得缓慢。 | |||
Sma我:缺口的unmethylated一串半甲基化CC5米CGGG。 | |||
Spe我:劈开半甲基化的5米CTAGT缓慢。 | |||
Xba我:劈开半甲基化T5米CTAGA,但其消化速度变得非常缓慢(小于1/100)。 | |||
Xho我:劈开CT5米CGAG非常缓慢。 | |||
半-甲基化DNA表示两条链中有一条被甲基化的DNA,()表示相对速度。 | |||
4. | Takara Bio,未发表的观察结果。 |
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