癌症生物标志物的发现
癌症是一种由基因突变以及转录、表观遗传学和蛋白质组学特征变化引起的多基因疾病。这些变化可以作为早期发现/诊断和个体化治疗发展的有价值的生物标志物。几种已知癌基因的突变(例如。,表皮生长因子受体,HER2,喀斯特)和肿瘤抑制基因(例如,TP53,PTEN,PI3K)已经被用作生物标记,用于指导乳腺癌、卵巢癌、肺癌和前列腺癌等癌症的治疗。
下一代测序(NGS)分析极大地促进了血液、尿液、唾液、胸腔积液和脑脊液(即非侵入性液体活组织检查)中循环核酸的癌症生物标记物发现,其中可能包含肿瘤衍生的遗传信息(Siravenga et al.2017)。使用NGS以经济高效的方式同时对整个基因组或数千个突变进行测序,可作为生物标记物检测和发现的有力工具。从循环肿瘤DNA(ctDNA)收集的分子图谱可进一步补充通过分析循环肿瘤细胞(CTC)获得的图谱,以及细胞衍生囊泡内所含的RNA、蛋白质和脂质,如外小体。
最近的癌症生物学进展强调了外泌体作为癌细胞及其直接和遥远环境之间的遗传和生物信息的载体的重要性。癌细胞分泌含有多种分子的外泌体,这些分子可以转移到受体细胞,反之亦然,以诱导大量的生物过程,包括血管生成、转移形成和治疗耐药。因此,外泌体的分子负载是发现新型癌症生物标志物的丰富来源(Sundararajan等,2018)。
突出产品
我们提供创新的技术,以加快您的癌症生物标志物发现工作流程,包括我们的SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit(图1)设计用于构建来自存在于诸如无细胞DNA(CFDNA)和循环肿瘤DNA(CTDNA)的DNA中的NGS文库。我们的化学方法已被优化,以有效地与血样合作,与全外末端测序或特定基因面板的主要目标富集平台相容。而且,我们的智慧血液技术已经过去了成功使用和引用包括Murtaza et al.,Xia et al.,和Patel et al.在内的许多研究小组通过对不同类型癌症液体活检中的ctDNA进行测序,证明了无创监测肿瘤化疗耐药性的适用性。
图1所示。SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit单管工作流程。创建索引库从1到30 ng的细胞游离DNA开始,通过三个简单步骤:末端修复,适配器连接,和高保真库扩增。不需要纯化或样品转移步骤。简化的工作流程在单管或井中只需2小时即可完成,防止了样品丢失,并提高了阳性样品识别能力。
加速从外泌体分子货物(如microrna)中发现癌症生物标志物的工具包括我们的捕获外泌体分离试剂盒(细胞培养),可快速(<30分钟)和容易地从细胞培养基中分离外泌体。我们的聪明smRNA-Seq工具包对于Illumina提供了一种流线型和快速的NGS工作流程,用于全局分析小RNA(SMRNA),从外泌体,血浆和血清中提取的RNA的皮卡数量。事实上,Guelfi等成功利用我们更智能的SMRNA-SEQ试剂盒,用于在前列腺癌诊断中进行非侵入性生物标志物发现的基于NGS的miRNA分析(Guelfi等,2017)。
参考文献
Siravegna G。et al。将液体活组织检查集成到癌症的管理中。Nat,启中国。肿瘤防治杂志。14,531 - 548(2017)。
Sundararajan V。et al。外泌体在癌症进展中的多功能作用:诊断和治疗意义。细胞。肿瘤防治杂志。41,223-252(2018)。
引用SMARTer ThruPLEX-Plasma Seq Kit用于肿瘤化疗耐药性的无创监测的出版物智慧smrna-seq套件前列腺癌诊断中的miRNA分析
Guelfi G。et al。尿液去角质细胞的下一代测序:前列腺癌细胞研究的方法。科学。代表。8,7111(2018)。
Mayrhofer, M。et al。转移前列腺癌的无细胞DNA分析显示微卫星不稳定性,结构重排和克隆血液血液。基因组医学。10,85-98(2018)。
Mouliere F。et al。从胶质瘤患者中检测脑脊液中无细胞DNA碎片和拷贝数改变。EMBO。12,e9323(2018)。
穆尔塔扎,M。et al。通过血浆DNA测序对获得性癌症治疗耐药性进行非侵入性分析。自然497年,108 - 112(2013)。
Patel,K. M.et al。肌肉浸润性膀胱癌患者血浆和尿液突变DNA与临床结局的关系。科学。代表。7,5554(2017)。
夏,Y。et al。作为晚期前列腺癌生物标志物的尿游离DNA拷贝数变化。Oncotarget7,35818-35831(2016)。
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