t细胞受体分析
细胞免疫是由T细胞介导的,它直接参与通过T细胞受体(TCRs)检测和中和致病威胁。鉴于tcr -抗原相互作用的相对特异性,需要tcr的高度多样性来识别无数的病原体。为此,适应性免疫系统已经进化出一种在所有生物学中无可匹敌的tcr体细胞多样化机制。细胞是形成两种截然不同的亚基组成的链,最常见的是α和β链,从而从体细胞重组过程称为V (D) J重组(图1)。一个广泛的T细胞与不同的识别序列是至关重要的免疫系统识别突变蛋白质和neoantigens从肿瘤细胞。应用于癌症的免疫基因组学的一个挑战是确定T细胞库和识别肿瘤反应性T细胞克隆,在癌症患者接受免疫治疗之前和应答(Liu et al. 2017)。
图1所示。t细胞受体的结构和多样化。面板。一种由α-和β-亚基链组成的功能性αβ TCR异源二聚体。TCR-α亚基链由“可变”(V)、“连接”(J)和“恒定”(C)片段组成,分别用洋红、蓝色和绿色表示,而TCR-β亚基链包括这些片段和一个额外的“多样性”(D)片段,用橙色表示。TCR-β亚基的CDR3区域被标记。TCR表现在t细胞表面,与APC表面MHC分子相关的抗原结合。面板B。TCR-β亚基链的V(D)J重组和转录后加工。TCR-β位点包括50多个V片段(品红色)、2d片段(橙色)和13个J片段(蓝色)。在体细胞多样化过程中,每一种片段类型中至少有一种是随机选择的,进一步的变异是通过添加和删除额外的核苷酸来引入的(黄色)。TCR mRNA的剪接结合了各自片段的子集(连同一个固定区域)成为一个连续的单位。TCR-α亚基链是通过类似的机制产生的。
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的smart Human scTCR a/b Profiling Kit能够充分捕获TCR-α和TCR-β可变区,以阐明单个t细胞内TCR α/β配对信息。此外,高通量智能人类TCR a/b分析现在可以在单细胞ICELL8 cx平台上从> 1000个单细胞中捕获完整的V(D)J可变区TCR转录本。
引用:
刘学森,刘学森。免疫基因组学在癌症研究中的应用。细胞168年,600 - 612(2017)。
Wegehaupt, a K。et al。从LR Express滤过器中回收和评估白细胞。生物制剂49岁,第15 - 22(2017)。
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