癌症基因组学与表观组织
基因组改变如突变,拷贝数变化和结构变化,与表观遗传景观(即DNA甲基化状态)的困难,是癌症的标志。全基因组测序和靶向测序方法主要集中在躯体变异和CNV的检测,允许癌症研究人员获得基因组改变的全面图像。诸如Exome或面板测序的靶向方法,重点关注特定区域或感兴趣的基因,并允许更深入地测序对于全基因组测序的变体检测的敏感性增加。另一方面,表观遗传方法已被证明可用于描述癌症特异性DNA结合蛋白,组蛋白修饰和DNA甲基化构成的癌细胞。了解这些表观遗传变革如何与肿瘤发作和进展的基因组改变以及对治疗的抗肿瘤抵抗力,对改善癌症护理非常重要。
突出产品
我们提供许多创新技术,以加快您的全基因组和靶向测序工作流程的体细胞变异和CNV发现,包括我们的专利smartthruplex技术。我们所有的SMARTer ThruPLEX套件都旨在通过单管、两小时、三步工作流程减少用户错误、样品损失和污染(图1)SMARTer ThruPLEX DNA-Seq Kit允许从picg数量的DNA,包括FFPE样品和ChIP DNA构建NGS库。的更聪明的刺穿等离子体 - SEQ套件专门设计用于无细胞DNA(CFDNA)和循环肿瘤DNA(CTDNA)。最后,这是更智能的Thuplex Tag-SEQ套件含有超过1600万个独特的序列,用于在放大之前标记单个DNA片段,允许通过图书馆制备,目标富集和数据分析过程跟踪片段以检测低频等位基因或计数单个碎片。
更智能的Thuplex技术也与之兼容,并已验证使用,以便与Agilent SureSelect,Roche NimblegeSEQCAP EZ和IDT Xgen Lockdown探测器一起验证。此外,已经成功地利用了智慧血液化技术,并引用了各种类型的癌症的全基因组测序,靶向测序,CNV分析和芯片-SEQ研究。
引用使用更智能的血换技术对全基因组测序的使用,靶向测序,CNV分析和各种类型癌症的研究包括以下内容:
Cato,L.et al。Bag-1L作为雄激素受体依赖性前列腺癌治疗靶点的研究进展eLife6,E27159(2017)。
Jeselsohn, R。et al。等位基因特异性染色质招募和治疗脆弱性ESR1激活突变。癌细胞33,173-186(2018)。
金,X.et al。通过组合BMI1和EZH2抑制来靶向胶质瘤干细胞。自然医学。23,1352 - 1361(2017)。
Klevebring D。et al。exome测序评估以估算血浆中肿瘤负荷。普罗斯一体18,E104417(2014)。
马克斯,H.et al。评估影响血浆DNA分析的分析前因子。科学。代表。8,7375(2018)。
麦克纳泰,C.et al。RB状态对人类癌症E2F1重新编程的差异影响。J. Clin。投资。128年,341-358(2018)。
穆尔塔扎,M。et al。血浆DNA序列抑制对癌症治疗的无侵袭分析。自然497年,108-112(2013)。
Patel,K. M.et al。血浆和尿突变体DNA与肌肉侵入性膀胱癌临床结果的关系。科学。代表。7,5554(2017)。
王,X.et al。嘌呤合成促进胶质瘤中脑肿瘤引发细胞的维持。自然神经科学。20,661 - 673(2017)。
Weiss,G. J.et al。肿瘤细胞游离DNA拷贝数不稳定预测治疗对免疫治疗的反应。临床。癌症res。23,5074-5081(2017)。
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