癌症生物标志物的发现
癌症是一种多基因疾病,起因于基因突变以及转录、表观遗传和蛋白质组特征的改变。这些变化可以作为早期检测/诊断和发展个体化治疗的有价值的生物标志物。几种已知的致癌基因突变(例如,表皮生长因子受体,HER2.,克拉斯)和肿瘤抑制基因(例如,TP53,PTEN,PI3K)已经被用作生物标记,用于指导乳腺癌、卵巢癌、肺癌和前列腺癌等癌症的治疗。
下一代测序(NGS)分析极大地促进了血液、尿液、唾液、胸腔积液和脑脊液(即无创液体活检)中循环核酸的癌症生物标志物发现,其中可能包含肿瘤来源的遗传信息(Siravenga等人2017年)。利用NGS对整个基因组或数千个突变同时进行高效测序,可以作为生物标志物检测和发现的有力工具。从循环肿瘤DNA (ctDNA)中收集的分子谱可以与通过分析循环肿瘤细胞(CTCs)、RNA、蛋白质和细胞源性囊泡(如外泌体)中所含的分子谱进一步补充。
最近的癌症生物学进展强调了外泌体作为癌细胞及其直接和遥远环境之间的遗传和生物信息的载体的重要性。癌细胞分泌含有多种分子的外泌体,这些分子可以转移到受体细胞,反之亦然,以诱导大量的生物过程,包括血管生成、转移形成和治疗耐药。因此,外泌体的分子负载是发现新型癌症生物标志物的丰富来源(Sundararajan等,2018)。
突出产品
我们提供创新的技术,以加快您的癌症生物标志物发现工作流程,包括我们的SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit(图1),用于从体液中存在的DNA(如细胞游离DNA (cfDNA)和循环肿瘤DNA (ctDNA))构建NGS库。我们的化学经过优化,可以有效地处理血液样本,并与用于全外显子组测序或特定基因面板的领先靶标富集平台兼容。此外,我们的智能ThruPLEX技术已经成功使用和引用包括Murtaza et al., Xia et al.和Patel et al.在内的许多研究小组证实了非侵入性监测肿瘤化疗耐药的适用性,通过对不同类型癌症的液体活检中的ctDNA进行测序。
加速从外泌体分子货物(如microrna)中发现癌症生物标志物的工具包括我们的捕获外泌体分离试剂盒(细胞培养),可快速(<30分钟)和容易地从细胞培养基中分离外泌体。我们的聪明smRNA-Seq工具包对于从外泌体、血浆和血清中提取的微微克数量的RNA, Illumina提供了一个流线型和快速的NGS工作流,用于小RNA (smrna)的全局分析。的确,Guelfi等人成功地利用我们的SMARTer smRNA-Seq Kit开展了基于ngs的miRNA分析,用于前列腺癌诊断中的无创生物标志物发现(Guelfi等人2017)。
参考
Siravegna G。et al。将液体活组织检查纳入癌症治疗。Nat,启中国。肿瘤防治杂志。14,531 - 548(2017)。
Sundararajan V。et al。外泌体在癌症进展中的多功能作用:诊断和治疗意义。细胞。肿瘤防治杂志。41岁的223 - 252(2018)。
引用SMARTer ThruPLEX-Plasma Seq Kit用于肿瘤化疗耐药性的无创监测的出版物SMARTer smRNA-seq Kit formiRNA谱分析在前列腺癌诊断中的应用
Guelfi G。et al。尿液脱落细胞的下一代测序:前列腺癌microRNAs研究的一种方法。科学。代表。8,7111(2018)。
Mayrhofer, M。et al。转移性前列腺癌的无细胞DNA分析显示微卫星不稳定性、结构重排和克隆造血作用。基因组医学。10,85 - 98(2018)。
Mouliere F。et al。胶质瘤患者脑脊液中细胞游离DNA片段和拷贝数改变的检测EMBO。12,e9323(2018)。
穆尔塔扎,M。et al。通过血浆DNA测序对癌症治疗获得性耐药性的非侵入性分析。自然497年,108 - 112(2013)。
帕特尔,k . M。et al。肌肉浸润性膀胱癌患者血浆和尿液突变DNA与临床结局的关系。科学。代表。7,5554(2017)。
夏,Y。et al。在晚期前列腺癌中,尿液细胞游离DNA作为生物标志物的拷贝数变化。Oncotarget7,35818 - 35831(2016)。
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