两种RNA等值方法显示常住内存T细胞拥有逆肝纤维化电量
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肝纤维化长期以来被认为是不可逆的,但最近的研究表明,纤维化是可以逆向的。近代研究《自然通信报》Koda等人开发并描述鼠标肝纤维解析新模型.使用新鼠标模型并组合单细胞RNA-seq和批量mRNA-seq来通知功能研究,显示特殊类型Te
NAFLD和NASH点燃导致肝纤维化
非酒精脂肪肝病目前是世界上慢性肝病的主因NAFLD特征为脂肪超量积聚,称为Stiatostistaticis从隔离到非酒精steatitis(NASH)等条件不等,肝脏叶发炎NAFLD和NASH患者子集开发肝纤维化,可发展成肝硬化或肝癌
分子层次上,与NAFLD和NASH相联的重复肝细胞毁灭制造一种炎情环境,渗透性免疫细胞释放各种化学素和细胞素化学素和细胞素引导肝状星格激活曾激活后,是肝纤维化的主驱动.
鼠标肝纤维解析新模型
研究解决肝纤维化机制,作者首先需要模型系统观察肝纤维化解析鼠持续喂高脂肪高胆固醇以诱导NASH,24周后高脂肪高胆固醇饮食转鼠正常饮食小鼠展示肝纤维化的清晰证据 而在HFHC饮食中 8周后 鼠改用正常饮食
图1ifersd、HFHC和RES小鼠8周图片改编自Koda等2021纳特通信网下方CC BY4.0牌照
破解机制逆肝纤维化使用单细胞和散装mRNA-seq
作者观察说,ERS模型中CD8+T细胞水平仍然较高,小鼠喂饱正常饮食,因此他们假设该细胞群可能在肝纤维解析中发挥作用。scRNA-seq分组CD8+T17集群大鼠喂饱正常饮食(ND鼠)、小鼠持续喂饱高脂肪高胆固醇饮食(HFHC鼠)和RES模型小鼠并分组成四大CD8+T子集有趣的是,RES模型鼠展示CD8+T子集增富:内存T细胞
图2UMA预测肝脏CD8+T细胞取自ND(左转)、HFHC(中转)和RES(右转)鼠trm子集内各鼠标模型的集群概述图像改编Koda等2021纳特通信网.下方CC BY4.0牌照
深入了解tm细胞对肝纤维解析作用,作者使用大容量全长RNA-seq解析法SMART-seq v4超低输入RNA插件.这种方法允许比较ERS小鼠、HFHC小鼠和ND小鼠的CD8+T子数组mRNA-seq大数数据不仅证实了scRNA-seq数据,而且分析还显示ERS和HFH小鼠Trm细胞中细胞毒理和化学调解员的升级调控强控基因Ccl5特别感兴趣,因为这个隐型基因产品的相应受体表示出Hepistic星格解析阶段,而非Fibrois阶段从解析归纳数据中的线索中, 作者接着进行了功能性研究显示trm细胞以CCR5依赖方式专门吸引并诱导Hepatic星格中的poti
科达和同事证明 研究者不应该选择单机或大容量RNA排序法使用两种方法使研究者不仅能识别哪些细胞类型应集中使用,而且还能深入转录机基于这些数据的功能研究发现生物机制有可能被操纵处理NAFLD、NASH和肝纤维化
和我们认为良好的科学
引用
科达市et al.CD8+组织寄存存储器T细胞通过诱导肝状星云细胞分解促进肝纤维解析纳特通信124474(2021)。
TsuchidaT.FriedmanS.S.赫帕蒂电流细胞激活机制Nat RevGastroentolHepatol14号397-411(2017年)。
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